В конце 1930-х годов, во время Большого террора, Берия реанимировал идею «шарашек» — научно-технических тюрем, в которые, по мнению властей, следовало отправить арестованных специалистов, конструкторов и только так заставить их работать в интересах обороноспособности страны (первые шарашки появились в конце 20-х).
В 1937-38 годах арестован весь цвет авиаконструкторов. В том числе и Андрей Туполев. Он, уже под конвоем, составит список заключенных коллег, кого бы хотел видеть в своем спецтехотделе. Их разыскивают по лагерям, в том числе и Сергея Королева, который отбывает срок на Колыме.
«Шарашки» работают по разным направлениям, многие, включая Туполевскую — это ЦКБ-29 НКАД, над проектами фронтовых самолетов. Разработка и выпуск продолжится в эвакуации в Омске и Казани. До начала космической программы еще лет 10, но многие ее ключевые фигуры проходят свой путь испытаний через закрытые спецтехотделы. Многие документы по ним до сих пор не рассекречены.